Brotten ska ha ägt rum i trakten kring Uppsala den 19 och 20 september 2009. Mannen ska enligt åklagaren ha våldtagit en kvinna han umgåtts med i sitt fritidshus. Han är även anklagad för att ha slagit kvinnan i ansiktet.
Efter övergreppet ska polismannen ha hotat om att döda kvinnan om hon anmälde händelsen till polisen.
Det var chefsåklagaren vid riksenheten för polismål, Monica Mimer, som på tisdagen den femte januari väckte åtalet vid Uppsala tingsrätt.
Polismannen som är anställd vid Säpo, Säkerhetspolisen, sitter häktad.
Åtalet gäller dels grov våldtäkt och dels övergrepp i rättssak. Mannen nekar till brott, men enligt åklagaren är bevisningen mot honom stark.
– Jag bygger åtalet på uppgifter från vittnen, kvinnan själv och dessutom har jag teknisk bevisning, säger chefsåklagare Monica Mimer till TT.
Förundersökningen är sekretessbelagd och Åklagarmyndigheten meddelar att Monica Mimer inte kommer att lämna några ytterligare uppgifter innan rättegången påbörjas.
På måndag den 11 januari inleds rättegången som beräknas pågå i fem dagar.
Övergrepp i rättssak är ett brott som innebär att man angriper någon genom våld eller hot för vad han eller hon sagt inför domstol, eller för att en person väckt talan eller har försökt hindra någon att väcka talan eller vittna inför domstol. Påföljden är böter eller fängelse i högst två år.
Påföljden för våldtäkt är fängelse i lägst två år och högst sex år.